内分泌失调

胚胎着床和继续发育依赖于复杂的内分泌系统的协调，任何一个环节失调都可能导致流产。在胚胎发育的早期，需要三个重要的激素水平，一个是雌激素，一个是孕激素，一个是人绒毛膜促性腺激素。作为母亲，如果自身内源激素不足，就不能满足胚胎的需要，就可能导致胚胎悬浮和流产。其中，黄体期功能障碍是最常见的一种。黄体期功能障碍可引起子宫内膜发育迟缓和黄体期过短，从而影响受精卵着床或早孕流产。黄体功能不全常伴有其他腺体功能障碍，如甲亢或甲减、糖尿病、雄激素相对增加和高泌乳素血症等。这些因素不利于胚胎发育，与流产密切相关。

子宫异常

子宫内环境和子宫整体环境都可能影响胚胎。是内环境的子宫内膜。太薄或太厚都会影响着床。因子宫缺陷导致的流产约占10%~15%。常见的有:(1)先天性苗勒氏管异常包括单角子宫、双角子宫、隔膜子宫、双角子宫，导致宫腔狭窄，血供受限。子宫发育异常会导致结缔组织障碍和异常着床。(2)子宫粘连，主要由宫内外伤、感染或胎盘组织残留引起。它阻碍正常的蜕膜化和胎盘植入。(3)子宫肌瘤和子宫内膜异位症引起的血供减少，导致缺血和静脉扩张，结缔组织障碍，子宫肌瘤引起的异常着床和激素变化，也可导致妊娠失败。(4)先天性或外伤性宫颈内口松弛及己烯雌酚宫腔内处理常导致宫颈发育异常，常导致中期妊娠流产。

染色体问题

如果染色体异常，胚胎就不会发育，导致早期流产。染色体异常包括数量和结构异常。数量异常可分为非整倍体和多倍体。最常见的异常核型是非整倍体三体，16三体占1/3，往往是致命的。25-67%的21-三体、4-50%的13-三体和6-33%的18-三体必然流产。还有其他单倍体(45，XO)，四倍体胚胎因卵裂异常而不发育。异常结构缺失、平衡易位、倒位、重叠等。

配偶一方染色体的平衡易位容易导致胚胎中染色体异常，从而导致胚胎悬浮。胚胎中染色体异常的机制是夫妻染色体融合时染色体片段容易丢失或重复，导致受精卵染色体发育异常，可导致流产、死胎、畸形。因此，对于孕中期染色体易位的夫妇，需要进行产前诊断，防止生出染色体疾病的孩子。染色体异常，理论上有机会生出正常核型和携带者的婴儿。应该对这些夫妇进行产前诊断，以确保正常婴儿的出生。

携带遗传物质的精子异常会导致胚胎流产，但精子异常指的是精子的外观，而不是精子携带的遗传物质。精子形态学评估用于评估男性的生育能力。畸形精子是指在自然状态下没有机会与卵子相遇的精子，所以畸形精子携带遗传物质是否正常并不重要。所以精子异常与自然流产无关。精子畸形率是精液指数的一个百分比，必须结合精子总数来评估。

免疫因素

由免疫因素引起的胚胎-胎儿停止相对少见，无法明确诊断。免疫理论是指母亲怀孕后，由于胎儿是父母遗传物质的结合体，与母亲不可能一模一样，所以认为是同种异体移植，母亲与胎儿的免疫不相容导致母亲排斥胎儿。但是，我们没有办法知道停止生育的原因是否是因为母体对胚胎的排斥。但是，从逻辑上来说，如果胚胎是被母体打掉的，应该发生的比较早，而不是在胚胎有心脏之后。封闭抗体只是免疫治疗后的一个控制指标，不能作为胚胎悬浮的病因诊断。绝大多数女性在非妊娠期间封闭抗体为阴性，只有少数女性即使在妊娠中期也能检测到封闭抗体。

生殖道感染

除上述因素外，感染引起的早孕流产越来越受到国内外学者的关注。孕早期TORCH感染严重可导致胚胎死亡或流产，轻度感染也可导致胚胎畸形。研究表明，巨细胞病毒可导致过期流产和胎儿宫内死亡。母体感染后，病原体可通过血液感染胎盘，造成绒毛膜和毛细血管内皮的损伤，破坏胎盘屏障，病原体进入胎儿体内会引起流产、胚胎停止发育和胎儿畸形。近年来，许多研究表明，支原体感染可能与胚胎停止发育有关，但也有学者提出，支原体可以是人体的正常菌群，通过反复流产人群的筛查发现的支原体只能称为支原体存在而不能称为支原体感染。

环境因素

孕期生理状态的改变，极大地改变了母体对治疗药物和各种环境有害物质的吸收、分布和排泄。在发育的早期，胚胎对治疗药物和环境因素的作用极其敏感，此时各种有害因素均可导致胚胎的损伤甚至丢失。许多药物和环境因素是导致胚胎早期死亡或胎儿畸形的重要因素。环境激素可直接作用于中枢神经内分泌调节系统，引起生殖激素分泌紊乱，繁殖率下降，胚胎发育异常。引起流产的环境因素有多种，包括X射线、微波、噪音、超声波、高温等物理因素，以及铝、铅、汞、锌等重金属影响受精卵着床或直接损伤胚胎，导致流产。各种化学物质，如二氯丙烷、二硫化碳、麻醉气体和口服降糖药等，均可干扰和损害生殖功能，导致胚胎流产、死胎、畸形、生长迟缓和功能障碍。以及不良生活习惯如抽烟、喝酒、喝咖啡、吸毒、某些药物等。影响早期胚胎发育。