1.输卵管炎症。可分为输卵管粘膜炎和输卵管周围炎症，两者都是输卵管妊娠的常见原因。输卵管黏膜炎严重时可造成管腔完全阻塞，导致不孕，而轻则输卵管黏膜粘连、纤毛缺损会影响受精卵的运作，在那里着床。淋球菌和沙眼衣原体引起的输卵管炎常累及粘膜，而流产或分娩后感染常引起输卵管周围炎。
2.输卵管手术。输卵管绝育术后若形成输卵管再通或瘘，可能导致输卵管妊娠，尤其是腹腔镜电凝输卵管绝育术和硅胶环套。因为不孕，我们接受过输卵管分离粘连，输卵管成形术，比如输卵管吻合术，输卵管开通术等。，再次输卵管妊娠的发生率为10% ~ 20%。
3.输卵管发育不良或功能障碍。输卵管发育不良常表现为输卵管长，肌肉发育不良，缺乏粘液纤毛。还有其他的双输卵管、憩室或阳伞，都可以是输卵管妊娠的原因。如果雌孕激素分泌异常，可影响受精卵的正常运作。此外，精神因素也会引起输卵管痉挛和蠕动异常，干扰受精卵的运输。
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