有药物治疗和手术治疗。
1.药物治疗:原则是子宫内膜异位症是一种雌激素依赖性疾病。只要雌激素水平降低，子宫内膜异位症的发展就可能停止。因此，目前使用的一些药物，如大剂量黄体酮胶囊(丸)、克罗米芬、来曲唑等。还有一些中药也有治疗作用，如桂枝、附子、乌药。
2.手术治疗:手术治疗子宫内膜异位症主要是卵巢上的子宫内膜异位症形成的巧克力囊肿，可用于切除卵巢子宫内膜异位囊肿，切除盆腔病变，切除深部结节性子宫内膜异位症病变，治疗子宫腺肌病。
此外，还有一种环是高效孕激素的载体，也叫曼月乐。放入宫腔后，对部分子宫内膜异位症、子宫腺肌病患者也有一定的治疗作用。
