1.痛经和下腹痛。子宫内膜异位症的病因包括卵巢巧克力囊肿、子宫腺肌病、盆腔子宫内膜异位症结节，即小病灶。因为内出血发生在子宫内膜异位症病灶内，血液在子宫内膜异位症病灶内积聚，没有办法让它流出来。如果中医认为不合理，就会引起小腹疼痛或痛经。这种疼痛往往始于月经前或经期前，持续整个月经周期。一般来说，
2.性交不适。子宫内膜异位症患者因病变而凹陷的子宫和直肠或固定的子宫，在性交时因碰撞或子宫收缩、提拉而引起疼痛。月经前房事疼痛更明显，因为子宫内膜异位症病灶开始出血，所以房事前疼痛更明显；
3.不孕不育。如果女性患有子宫内膜异位症，盆腔会因为子宫内膜异位症而与盆腔粘连，堵塞输卵管，使精子无法与卵细胞正常受精或受精卵无法送入子宫，从而导致女性不孕。也可能是由于卵巢子宫内膜异位症，如卵巢内巧克力囊肿，导致排卵障碍，不排卵会导致不孕。
4.异位妊娠。异位子宫内膜会引起盆腔粘连。发生盆腔粘连时，输卵管堵塞，受精卵不能顺利运送到宫腔。受精卵可以停留在子宫外的任何部位，如输卵管、卵巢、肠道，甚至网膜。当受精卵停留在这些部位时，其生长发育就会导致宫外孕。
5.月经不调。如果女性患有子宫内膜异位症，会对女性的正常月经产生很大的影响。卵巢子宫内膜异位症病变，如卵巢巧克力囊肿，可能引起排卵障碍，导致月经不调。子宫肌层的子宫内膜异位症病变为子宫腺肌病，会导致月经延长、月经周期缩短、月经量过多等月经异常表现。
6.当腰痛、血尿、严重异位子宫内膜侵犯或压迫子宫旁输尿管时，可出现输尿管积水，导致尿流不畅或肾积水，一侧腰痛或血尿；
7、腹泻、便秘、肠梗阻等症状，由于子宫内膜可达头部，肠道内子宫内膜异位症患者可出现腹痛、腹泻、便秘或少量便血的周期性症状，并伴有月经便血。严重者可出现肠梗阻，因为直肠或乙状结肠受到子宫内膜异位症病灶的压迫；
8.恶性转化。很少有子宫内膜异位症患者会发生恶变。比如巧克力囊肿发展成卵巢癌。这在临床上是可以发生的，但发生的概率很低，临床上要定期随访。
